可以，深圳市交警部門規定，符合條件的車主可以通過交警部門授權的代辦機構代辦電動自行車注銷業務。以下是具體的流程：

1. 車主需要準備好身份證件、車輛行駛證、車輛登記證書等相關材料。

2. 找到一家交警部門授權的代辦機構，可以在交警部門網站上查找。

3. 前往代辦機構提交申請，填寫相關表格并繳納相應的費用。

4. 代辦機構會協助車主進行電動自行車注銷手續，并將車主需要向交警部門繳納的罰款、滯納金等費用代為繳納。

5. 注銷完成后，代辦機構會給車主提供相關證明材料。

需要注意的是，車主在代辦注銷前需要確保所有罰單都已處理完畢，否則會影響注銷業務的進行。同時，代辦機構收取的費用可能會略高于直接前往交警部門辦理，建議在選擇代辦服務時注意核實收費標準。